Arria® 10 GX の Transceiver Block において RX PMA の設定で、CTLE Mode が "Manual" と "Triggered" があります。どの様に使い分ければ良いのですか？

Arria^® 10 GX + Native PHY の構成であれば、CTLE : Manual で使用し、QSF や Assignment Editor で任意の値を設定してください。
また、User Guide に記載のある通り、CTLE : triggered mode は PCIe Protocol で Gen3 構成の場合にのみ使用可能です。

Arria^® 10 Transceiver PHY User Guide
https://docs.altera.com/r/docs/683617/21.1/arria-10-transceiver-phy-user-guide/high-gain-mode

（5.1.2.1.4. Continuous Time Linear Equalization (CTLE) の High Data Rate Mode の項目）

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カテゴリ：トランシーバ
ツール：Quartus^® Prime
デバイス：Arria^® 10