Arria® 10 のコンフィグレーション ROM を EPCQL256 から MX25U256 に置き換えたら、コンフィグレーションができなくなりました。

"Disable EPCS/EPCQ ID check" を Enable に変更してください。

（参考）デバイス・コンフィグレーション - サポートセンター
https://www.altera.com/design/guidance/configuration

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カテゴリ：プログラミング/コンフィグレーション
ツール：Quartus® Prime
デバイス：Arria® 10