IP の User Guide には 3.0 に準拠していると記載されています。
L-Tile and H-Tile Avalon Memory-mapped IP for PCI Express User Guide
https://docs.altera.com/r/docs/683667/23.4/l-tile-and-h-tile-avalon-memory-mapped-ip-for-pci-express-user-guide/serial-data-interface
（PIPE Interface で検索してください）
（抜粋）
"6.1.6.2. PIPE Interface"
The Stratix 10 PIPE interface compiles with the PHY Interface for the PCI Express
Architecture PCI Express 3.0 specification.
ただし、一部 4.4.1 以降の信号も混在していますので、ご注意ください。
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カテゴリ：PCI-Express
ツール：-
デバイス：Stratix® 10