Convert Programming File 機能を使って SOF ファイルから POF ファイルを作成するときに「Create config data RPD」チェックボックスを有効にして RPD ファイルを作成しました。 .mapファイルに示されるチェックサムの情報は RPD ファイル用でしょうか？

いいえ、POF ファイルのチェックサム値です。
RPD ファイルはバイナリーファイルのため、チェックサム値は汎用のツールでご確認ください。

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カテゴリー：プログラミング・コンフィグレーション
ツール：Quartus® Prime
デバイス：-